Identification microbienne

L'identification microbienne à partir des résultats des cultures impose l'utilisation de l'ordinateur vu la complexité des bases de données. Le principe de base est un calcul de probabilités du taxon en fonction des caractères considérés comme tous équivalents. Voir Taxonomie : identifier par calcul

Deux possibilités sont offertes sur le site :

• un logiciel pHp utilisable uniquement en ligne, réalisé par Antoine GAUDIN en remplacement du logiciel de JNoël JOFFIN. Il est hébergé sur le site UPBM. CLIQUER https://lab.upbm.org/

• une feuille de tableur qui réalise, pour différentes galeries biochimiques, les calculs de probabilités et de concordance pour tenter d'identifier une bactérie ou un champignon inconnu isolé (lisible par excel ou openoffice) : https://www.techmicrobio.eu/ftp/Informatique/Tableur/identification2011.xls
• Transmettre vos remarques et éventuellement vos tableaux pour compléter la feuille ou la version en direct.

Attention : des erreurs sont possibles, en particulier dans les tableaux de % qui ont été rentrés “à la main”… Une mauvaise identification peut être liée à de telles erreurs.

Trouver les explications concernant les calculs dans le Dictionnaire des techniques (article Taxonomie).

Merci.