| Les deux révisions précédentesRévision précédenteProchaine révision | Révision précédente |
| dioxyde_carbone [2024/10/18 09:35] – [Cupule URE (API20E)] techmicrobio | dioxyde_carbone [2024/10/18 15:15] (Version actuelle) – [Cas du milieu ensemencé avec addition de glucides] techmicrobio |
|---|
| |
| ==== Cas du milieu ensemencé sans addition de glucides ==== | ==== Cas du milieu ensemencé sans addition de glucides ==== |
| Le tube de gauche montre clairement la culture bactérienne en anaérobiose : les bactéries en cause utilisent donc les peptones en anaérobiose puisque c'est le seul substrat carboné pour ces hétérotrophes. | |
| {{ :dioxyde_carbone:hl_1.jpg?200 |}} | ^{{ :dioxyde_carbone:hl_1.jpg?400 |}}^Le tube de gauche montre clairement la culture bactérienne en anaérobiose : les bactéries en cause utilisent donc les peptones en anaérobiose puisque c'est le seul substrat carboné pour ces hétérotrophes.^ |
| ==== Cas du milieu ensemencé avec addition de glucides ==== | ==== Cas du milieu ensemencé avec addition de glucides ==== |
| |
| {{ :dioxyde_carbone:hl_2.jpg?200 |}} | ^{{ :dioxyde_carbone:hl_2.jpg?800 |}}^ À gauche le tube glucose est ensemencé avec une souche (E. coli) tandis qu'à droite la même souche est utilisée mais le milieu est sans glucose. \\ Le tube de gauche est jaune sur toute la hauteur (respiration en surface très probable, fermentations en anaérobiose en bas). La souche est donc capable de métaboliser le glucose (glucose +) et elle est aéro-anaérobie.^{{ :dioxyde_carbone:hl_05.jpg?800 |}}^Le milieu glucosé est ensemencé par une souche (//Pseudomonas//) qui n'acidifie qu'en haut du tube : elle respire donc le glucose quand il y du dioxygène. Elle ne cultive pas en anaérobiose : elle est aérobie stricte. C'est le dioxyde de carbone qui est responsable de l'acidification.^ |
| À gauche le tube glucose est ensemencé avec une souche (E. coli) tandis qu'à droite la même souche est utilisée mais le milieu est sans glucose. Le tube de gauche est jaune sur toute la hauteur (respiration en surface très probable, fermentations en anaérobiose en bas). La souche est donc capable de métaboliser le glucose (glucose +) et elle est aéro-anaérobie. | |
| | |
| | |
| {{ :dioxyde_carbone:hl_05.jpg?200 |}} | |
| | |
| Le milieu glucosé est ensemencé par une souche (Pseudomonas) qui n'acidifie qu'en haut du tube : elle respire donc le glucose quand il y du dioxygène. Elle ne cultive pas en anaérobiose : elle est aérobie stricte. C'est le dioxyde de carbone qui est responsable de l'acidification. | |
| |
| |
| Si elle est lactose -, elle se tourne vers les peptones et va donc alcaliniser. Mais les acides produits par la fermentation des peptones vont neutraliser l'ammoniac dans le culot tandis que sur la pente l'acidification moins importante liée au dioxyde de carbone sera insuffisante pour peu que le dioxyde de carbone s'échappe du tube. La pente devient alors rouge. | Si elle est lactose -, elle se tourne vers les peptones et va donc alcaliniser. Mais les acides produits par la fermentation des peptones vont neutraliser l'ammoniac dans le culot tandis que sur la pente l'acidification moins importante liée au dioxyde de carbone sera insuffisante pour peu que le dioxyde de carbone s'échappe du tube. La pente devient alors rouge. |
| ==== Cas d'un milieu de Kligler avec une Salmonella ==== | ==== Cas d'un milieu de Kligler avec une Salmonella ==== |
| |
| |
| L'ensemencement d'un milieu de Kligler avec une souche de Salmonella va nous montrer le rôle du dioxyde de carbone. | L'ensemencement d'un milieu de Kligler avec une souche de Salmonella va nous montrer le rôle du dioxyde de carbone. |
| La souche fermente le glucose en anaérobiose (dans la gélose) et le respire en aérobiose. | La souche fermente le glucose en anaérobiose (dans la gélose) et le respire en aérobiose. |
| Après incubation on observe : | Après incubation on observe : |
| {{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella1.jpg?200 |}} | ^{{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella1.jpg?400 |}}^Le milieu est entièrement jaune : on l'interprète en lactose et glucose +… ^{{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella2jpg.jpg?400 |}}^Or, après 30 minutes bouchon enlevé, on observe le résultat attendu… (glucose fermenté , lactose -) :\\ La souche est devenue lactose - !!! \\ ^{{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella3jpg.jpg?400 |}} ^ En regardant le bouchon, on constate qu'il contient un opercule : \\ le bouchon devait être très serré et le dioxyde de carbone n'a pu sortir : il a continué l'acidification. Le bouchon enlevé a rétabli les choses… ^ |
| Le milieu est entièrement jaune : on l'interprète en lactose et glucose +… | |
| Or, après 30 minutes boucon enlevé, on observe : | |
| {{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella2jpg.jpg?200 |}} | |
| La souche est devenue lactose - !!! | |
| En regardant le bouchon, on constate qu'il contient un opercule : le bouchon devait être très serré et le dioxyde de carbone n'a pu sortir : il a continué l'acidification. Le bouchon enlevé a rétabli les choses… | |
| {{ :dioxyde_carbone:kligler_salmonella3jpg.jpg?200 |}} | |
| ===== Cas des cupules API ===== | ===== Cas des cupules API ===== |
| ==== Cupule URE (API20E) ==== | ==== Cupule URE (API20E) ==== |
| |
| ^{{:dioxyde_carbone:api_ure.jpg?150 |}}^Remarquer une coloration jaune en bas et rouge en haut… \\Manifestement, la quantité de vaseline fut insuffisante pour ce tube : \\l'alcalinisation superficielle est probablement liée au départ du CO2… (ce que l'on n'observe pas en milieu Urée Tryptophane (Indole) classique ^ | ^{{:dioxyde_carbone:api_ure.jpg?100 |}}^Remarquer une coloration jaune en bas et rouge en haut… \\ Manifestement, la quantité de vaseline fut insuffisante pour ce tube : \\ l'alcalinisation superficielle est probablement liée au départ du CO2… (ce que l'on n'observe pas en milieu Urée Tryptophane (Indole) classique ^ |
| |
| |
| {{ :dioxyde_carbone:api_20e_1.jpg?400 |}} | {{ :dioxyde_carbone:api_20e_1.jpg?400 |}} |
| |
| Dans la première galerie, remarquons que tous les tubes normalement vaselinés sont alcalins (rouges) et que le citrate (de Simmons) est vert alors que | Dans la première galerie, remarquons que tous les tubes normalement vaselinés sont alcalins (rouges) et que le citrate (de Simmons) est vert alors que dans la deuxième galerie, les couleurs sont différentes (avec une petite ambiguïté sur ADH par remplissage un peu trop important de la cupule).\\ |
| dans la deuxième galerie, les couleurs sont différentes (avec une petite ambiguïté sur ADH par remplissage un peu trop important de la cupule). | C'est l'utilisation des peptones (peptone de levure peut être) qui cause l'alcalinisation au lieu de la décarboxylation de l'acide aminé. Pour que celle-ci soit visible, il faut absolument que le CO2 soit conservé dans la cupule et que l'utilisation des peptones soit anaérobie (fermentation) : alors le CO2 maintient l'acidification de départ alors que la fermentation des peptones n'agit pas sur le pH (l'ammoniac produit est neutralisé par les acides de fermentation). Mais, si la souche dispose d'une décarboxylase (ou une ADH), alors l'alcalinisation pourra se développer.\\ |
| C'est l'utilisation des peptones (peptone de levure peut être) qui cause l'alcalinisation au lieu de la décarboxylation de l'acide aminé. Pour que celle-ci soit visible, il faut absolument que le CO2 soit conservé dans la cupule et que l'utilisation des peptones soit anaérobie (fermentation) : alors le CO2 maintient l'acidification de départ alors que la fermentation des peptones n'agit pas sur le pH (l'ammoniac produit est neutralisé par les acides de fermentation). Mais, si la souche dispose d'une décarboxylase (ou une ADH), alors l'alcalinisation pourra se développer. | La même interprétation peut être faite pour Citrate de Simmons : il faut absolument que le CO2 produit s'échappe pour que l'alcalinisation apparaisse : elle est nette dans la partie ouverte du tube… et c'est pour cela que le tube est ouvert !\\ |
| La même interprétation peut être faite pour Citrate de Simmons : il faut absolument que le CO2 produit s'échappe pour que l'alcalinisation apparaisse : elle est nette dans la partie ouverte du tube… et c'est pour cela que le tube est ouvert ! | |
| La souche est //Klebsiella oxytoca// (le réactif de Kovacs n'est pas encore mis). | La souche est //Klebsiella oxytoca// (le réactif de Kovacs n'est pas encore mis). |
| |
